“令人沮丧的谜团”!新西兰遗传学家:第二波疫情爆发的原因仍未查出

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【新西兰生活网】新西兰遗传学家詹姆士·哈德菲尔德(James Hadfield)说,在奥克兰第二次爆发Covid-19疫情的原因仍然是一个“令人沮丧的”谜。

哈德菲尔德说:“疫情的重新爆发以及其来自何方,确实是一个谜。”

“从学术的角度来看,不知道疫情来源,这一点令人沮丧,知道它的来源对于整体的应对将是有益的,但目前不会阻止我们控制奥克兰的这个感染簇群。”

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自8月11日,奥克兰南区一个家庭的四名成员被检测出冠状病毒呈阳性以来,已经过去了两个多星期。

这些病例是在新西兰长达102天没有任何新的社区传播病例之后新出现的,在没有查明原因的情况下,奥克兰进入了三级警戒封锁状态。

哈德菲尔德先生说,这种病毒似乎是由一个从海外返回新西兰的人带入的,但是基因测试无法证明这一点。

对于管理隔离的人群,对Covid-19检测呈阳性的人中,约60%的人卫生部拥有其基因组序列。但是,其余40%则没有,所以很难知道疫情是否来自边境。

哈德菲尔德说:“测试和测序是不同的技术。”

“测序技术能够检测到非常少量的病毒,这是令人难以置信的结果。它可以在鼻拭子中检测到极少数量的病毒,从而返回阳性检测结果。”

他说,被隔离的人似乎不可能(实际感染但)两次测试中都得到假阴性结果,然后在隔离14天后继续在社区传播病毒。

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不过,哈德菲尔德说,其他情况同样(甚至更)是不可能的。

“其中一种情况是,在过去的100天里,社区中一直存在着持续,完全隐秘或隐藏的传播。”他说,这不太可能,因为这样的话病毒将被传播约15次而都未被发现。

坊间一直有一种强烈的猜测,说最近的病毒可能已经通过Mt Wellington的Americold冷藏商店进入。哈德菲尔德说:“现在看来,这基本上不在讨论范围之内。”

一名Rydges Hotel的工人感染后,基因组测序技术已帮助追踪到了感染源:住在同一酒店的一名美国人。Mt Albert最近的病例也已通过基因检测追溯到奥克兰南区感染簇群。

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但是哈德菲尔德说,第二疫情的原因仍然挖不出来。“但事实已经发生,很可能其中之一是真实的。”

哈德菲尔德先生在开源Nextstrain平台上工作,该平台使世界各地的科学家几乎可以实时比较Covid-19的遗传信息,并跟踪突变率和扩散。

来自全球100多个国家的研究人员在一个公共数据库中收集了80,000多个冠状病毒基因组。这有助于新西兰科学家调查病例可能起源的地方。

该新型冠状病毒通常每传播两次就突变一次。哈德菲尔德说,自科学家开始研究突变以来,没发现其传染水平有实质性的改变。